Как подходът с отворен код е въздействащ на науката

В тази нова категория на науката в рамките на „FOSS“, ние се потопим в вълнуващия свят на иновативната наука, за да проучим и разберем как Linux-базираната операционна система и Open Source играят значителна роля в големите научни открития, които се случват в нашата всекидневния живот.

Въздействието на подход с отворен код към науката

Източник на изображение: //www.sci-gaia.eu/osp-enab/

В бъдещи отчети ще се стремим да проучим мислите, споменати в заглавието на тази статия. Засега нека разгледаме следните ключови моменти:

прозрачност

Прозрачността е практика, която се счита за много ценна във всеки проект, който се предприема. Става въпрос само за това, доколко е отворен процесът на разпространението на споделяната информация. Прозрачността прави всеки вид действие лесно възприемчив, тъй като той играе важна роля в изграждането на ефективен процес на вземане на решения в рамките на организация или общност. Един прост пример за добра практика на прозрачност би бил пълен набор от записи на сделки между двама души или екипи, които са достъпни за справка по всяко време от двете страни.

Въпреки че прозрачността и отвореният код не са същите, и двете имат сходни идеологии. Подходът с отворен код винаги има положително въздействие върху прозрачността във всеки екип на проекта. Тъй като първоначалният изходен код е достъпен в публичното пространство и може да бъде пренасочен, става по-лесно за различни съвместни дейности да се раждат между различни групи или екипи, за да работят за решаване на научен проблем, който може да помогне на обществото. Говорейки за Linux, винаги е първото предпочитание в научните изследвания, като се има предвид естеството на софтуерните практики днес. Въз основа на различни наблюдения на изследователи, Linux е предпочитан първи и това е добра новина!

Качество на изследванията

Изследванията без качество винаги водят до намалена или никаква ефективност. Очевидно е как Linux и FOSS ще повлияят дълбоко на качеството на научните изследвания навсякъде по света. Ефектът върху прозрачността, както е разгледано по-горе, също има положителен ефект върху изследванията, защото когато софтуерът, използван за извършване на какъвто и да е научен анализ, е с отворен код, става по-лесно и по-лесно да се разберат експерименталните резултати и грешки. Той изключително помага за изолирането на причината за проблем с софтуера. Възможността за повторна употреба на научната работа за нейната първоначална или различна цел, т.е. приложимост, ще бъде възможна само когато оригиналния изходен код е наличен под ръка, което го прави абсолютно готово за разгръщане или отстраняване на грешки след извършване на актуализации с необходимите промени.

Поток от идеи

Както предлага този ключов момент, научните знания не трябва да се ограничават. Така възниква концепцията за отворен достъп. Open Source подкрепя духа на свободата на научното познание с неговия отворен модел. Собственият софтуер означава затворен източник, който предполага липса на прозрачност при разбирането на действителното й действие. Когато не разбираме как всъщност работи от сърцевината, не сме ли възпрепятствани от ефективно решаване на целевия проблем с необходимата точност? Времето, прекарано в репликиране или подобрение на такъв модел, би могло да бъде значително намалено, ако на първо място беше отворен код!

Неотдавнашно проучване беше публикувано от ScienceDirect, което разкри, че секторът с отворен код доминира в индустрията в сравнение с неговия собственик, когато разглежда дългосрочно. Това е направено чрез проучване и формулиране на техните взаимоотношения, съответстващи на НИРД.

Обхват на подобрението

Внимателното изучаване на кода с отворен код позволява на научния програмист да отбележи възможностите за подобрения, грешни грешки, които могат да бъдат жизненоважни за научната точност и прилагане на нови функции. Въвеждането на нови функции става много по-лесно, тъй като потребителят знае къде да ги прилага интелигентно в различните фрагменти от отворен код, всяка част от които е очевидно достъпна.

Спестявания при финансиране

Всяко научно изследване изисква достатъчно финансиране, за да работи ефективно за постигане на целта. За да можем да измислим или открием, ние се нуждаем от инструменти. Но когато става въпрос за софтуерни инструменти, е очевидно, че приемането на модел с отворен код ще намали разходите. Не е нужно да купуваме скъпа операционна система, докато изграждаме научна лаборатория. Компютрите са силно разчитани да извършват in-silico анализ и за щастие имаме огромно количество свободно достъпни научни операционни системи с отворен код и софтуер за работа по същото. Разходите, които влизат в закупуването на патентован софтуер, могат да бъдат оправдано използвани за извършване на действително изследване само чрез използване на софтуер с отворен код.

Списания с отворен код

Научните списания са източник на надеждна информация и изследователски новини. Интересното е, че сега дори имаме софтуерни списания, предназначени изключително за търсене на информация с отворен код. Един от тях е JOSS, т.е. списание на отворения софтуер, което е чудесен ресурс за разглеждане на софтуерни пакети за изследвания с отворен код. Списанието специално е проектирано с подход, съобразен с разработчиците. В следващите статии ще обсъждаме повече такива списания.

Отворена наука

Отворената наука е движение, което постепенно се превръща в революция, за да направи всяка научна работа достъпна за всеки, независимо от статуса на индивида или групата, които имат желание да знаят или да се учат. Това е описано в представеното изображение (от Sci-GaIA) на тази статия по много прост начин. Sci-GaIA насърчава използването и развитието на електронната инфраструктура в Африка. Идеята за отворената наука датира още от 1600-те години! Отворената наука се основава на четири основни ценности: отворен достъп, отворени данни, отворен код и отворени стандарти. Много страни имат пълни проекти за отворени данни. Тук са Франция, Индия и САЩ. Разгледайте тази красиво илюстрирана и интерактивна отворена научна страница на сайта Sci-GaIA!

Следват законите на Отворената наука:

  • Първи закон: Всички данни са отворени и всички идеи са споделени
  • Втори закон: Всеки може да участва на всяко ниво
  • Трети закон: Няма да има патенти
  • Четвърти закон: Предложенията са най-добрата форма на критика
  • Пети закон: Обществената дискусия е много по-ценна от частната електронна поща
  • Шести закон: Един отворен проект е по-голям от и не е собственост на дадена лаборатория

Посочените по-горе закони бяха заложени от визионер-учен и изследовател, Мат Тод в собствения си блог по повод на открито откриване на наркотици (OSDD - дискутирано по-долу) за малария. Следният видеоклип споменава първите три:

Неговият екип започна открито проучване на маларията, за да се бори с скандалната болест, която излага на риск милиарди хора по света. Тя се нарича проект „Малария с отворен код“, ресурс от подходяща информация, насочена главно към борба с маларията. Ето цялостна списание с отворен достъп до списанието за природата, в което се разглежда как и защо Open Source е изследователски ускорител!

Откриване с отворен код на наркотици (OSDD)

OSDD е инициатива за откриване на нови лекарства за борба с болестите с подход с отворен код. Бхарат Рамсундар, който инициира разработването на питон библиотека, основана на дълбоко обучение за откриване на лекарства, наука за материалите, квантова химия и биология, наречена DeepChem, написа забележителна статия за това защо трябва да се открива източник на наркотици. Като пример за DeepChem той ясно обясни концепцията, подчертавайки колко голямо е въздействието, когато научният софтуер е с отворен код.

В предстоящите статии за Science, ние ще разберем как възникващите тенденции в различни области се развиват чрез преосмислянето им с отворен код.

Препоръчано

Пълно ръководство за трикратно зареждане на Windows, Kubuntu и Debian
2019
GNOME 3.26 Издаден! Проверете новите функции
2019
3D отпечатване с отворен код: проучване на научни и медицински решения
2019